赵维莅教授团队开发的DLBCL基因分型简化算法（LymphPlex）

繁花似锦6666 · 发表于 2023-4-12 11:32:06

对于弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 这一最常见的非霍奇金淋巴瘤亚型，由于其生物学复杂性，将标准免疫化疗与靶向特定通路的新药相结合，以改善治疗结局的尝试遇到了困难。因此，通过简化分类算法进一步揭示 DLBCL 的分子异质性非常必要，从而提高结局预测的准确性和靶向治疗的疗效。DLBCL的分类策略很多，包括基于FISH（MYC、BCL2和/或BCL6重排；WHO分类的高级别淋巴瘤/三打击淋巴瘤）、基于基因表达谱的细胞起源（COO，分为ABC、GCB和未分类型）、染色体评估的GenClass遗传分类（分为GCD、BN2、N1和EZB）和LymphGen分类（包含N1、ST2、BN2、MCD、EZB、A53）等。基因亚型有助于揭示 DLBCL 在致癌通路参与、基因表达谱、预后价值和治疗脆弱性方面的多样性，但关于基因亚型的临床实践仍存在挑战。标本质量对测序的高需求、等待全外显子测序 (WES)/全基因组测序 (WGS) 生物信息学分析的时间相对较长、聚类算法的复杂性限制了其广泛应用。为提高临床使用的可行性，以及时使用基于基因亚型的靶向药物，人们对开发简化但高效的基因亚型分型方法有很大的需求。此前基于 GenClass 分类，利用18个基因突变和两个基因（BCL2和BCL6）重排开发了一个20个基因的分类算法，并通过一项前瞻性、2期、随机研究，探索了基因亚型驱动的靶向药物联合 R-CHOP (RCHOPX) 免疫化疗治疗新诊断 DLBCL 患者。根据近日《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF= 38.104）发表的一篇文章，通讯作者为赵维莅和许彭鹏教授，作者进一步开发了一种38基因分类算法（称为“LymphPlex”），使用35个基因突变和3个基因（BCL2、BCL6和MYC）重排确定了7种基因亚型，包括 TP53 突变 (TP53Mut)、MCD样、BN2样、N1样、EZB样MYC+、EZB样MYC-和 ST2 样；并在瑞金医院1001例新诊断 DLBCL 患者的大型队列中探索了这些基因亚型的临床病理学、预后、分子和微环境。LymphPlex 算分类可能为基因亚型分型提供一个有用的工具，从而促进精准医疗时代 DLBCL 治疗策略的优化。

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